Ao nascimento há uma junção abrupta entre o epitélio escamoso da ectocervix (o epitélio escamoso original) e o epitélio colunar da endocervix. Pela exposição ao estrogênio (ao nascimento, durante a puberdade e durante a vida reprodutiva), o glicogênio nas células esfoliadas da vagina é convertido em ácido lático, responsável pela acidez das secreções vaginais (pH <4,5). Essa acidez, juntamente com outros fatores, estimula a substituição do epitélio colunar pelo epitélio escamoso. Este processo é conhecido como metaplasia. A metaplasia resulta na formação de uma nova JEC. A área entre a JEC original e a nova JEC é conhecida como zona de transformação. As alterações metaplásicas geralmente começam a partir da periferia do ectrópio e se espalham em direção ao orifício externo. As alterações também podem ocorrer em discretas áreas do epitélio colunar. As novas células escamosas originam-se das células "de reserva" totipotentes que permanecem adormecidas sob as células colunares.
O processo de metaplasia começa com a fusão das pontas das vilosidades, seguido pela cobertura do epitélio colunar por um epitélio escamoso imaturo fino e transparente. O epitélio imaturo amadurece, com proliferação gradual e diferenciação das células escamosas. O epitélio escamoso maduro formado por metaplasia às vezes é indistinguível do epitélio escamoso original.
À medida que a metaplasia avança, é formada uma "nova" JEC, que gradualmente se move para dentro em direção ao orifício externo.
O epitélio metaplásico pode ser levemente acetobranco, e a absorção de iodo é frequentemente irregular.
A JEC original no limite externo da zona de transformação geralmente não é facilmente observada com o colposcópio. É definida como epitélio escamoso maduro sem epitélio glandular dentro ou abaixo dele. Algumas vezes coincide com a margem de absorção de iodo. O termo "JEC" durante a colposcopia sempre indica a nova JEC, a menos que especificado de outra forma.
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